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 植物
    境内木本植物共有259种。草本植物发现的有820种,采集鉴定标本249种,分属58科。由于山地的影响,气候条件沿垂直方向变化。随着高度的增加,植被也发生相应的改变,形成明显的植被垂直分带。商州的植被分带(区),可分为低山河谷栽培植被区,(海拔1200米以下),低中山针阔叶混交林带(海拔1200-1800米),中(高)山桦木林带(海拔1800米以上)。
    低山河谷栽培植被区
    此植被区主要分布于丹江、南秦河、板桥河、大荆河河谷川道及其两侧坡塬和山地,海拔1200米以下,山势较低,地形开阔平缓,水热条件较好,是境内主要的农作物、果树、用材树栽培区。本区的木本植物主要是落叶用材树、经济树。针叶树有天然的侧柏林,人工抚育的小片油松林。草本植物主要是各种农作物以及杂草。本区植被突出的特点是受人工影响大。
    粮食作物  3大类,20种,234个品种。
    禾谷类  玉米、小麦、水稻、大麦、谷子、糜子、高梁、荞麦、洋麦。
    豆类    大豆、小豆、扁豆、蔓豆、绿豆、豌豆、豇豆、黑豆。
    经济作物  油菜、蓖麻、大麻、芝麻、苎麻、花生、向日葵、烟叶、甜菜、荏子、仁罕、甜瓜、茴香、霍香、芦苇、黄花菜等。
    蔬菜作物  洋葱、春花白、夏花白、西红柿、黄瓜、辣椒、梅豆、南瓜、西戎芦、芹菜、香菜、韭菜、莴笋、菜花、冬瓜、笋瓜、丝瓜、葫芦、大白菜、白萝卜、大葱、秋花白、蔓青、莲菜、芥菜、热萝卜、苤蓝、茭白、大头菜、油白菜、胡萝卜、大蒜、菠菜、黑油菜、大青菜、刀豆、山药等。
    经济树  核桃、柿子、板栗、漆树、苹果、梨、桃、杏、葡萄、樱桃、猕猴桃、花椒、李梅等。
    用材树  侧柏林是此植被区内唯一的林带、分布于丹江及其主要支流沿岸坡地。一般为幼龄林,总覆盖度40-50%,平均树高4-8米,胸径一般为20厘米以下。林中星散分布的其他乔木有山刺柏、油松、黄连木等。林下有灌木和草本植物。刺槐呈零散分布,也有人工栽植的小片林,分布于谷坡及低山丘陵的坡面上。“四旁“栽植的用材树主要有红椿、白椿、中槐、白杨、泡桐等。
    灌木藤木类  马桑、酸枣、胡颓子、沙棘、锦鸡儿、榛子、黄栌、苦木、马皇梢、荆条、忍冬、柴穗槐、五味子、葛藤、南蛇藤、二花、卫茅等。
    药用植物  桔梗、白术、黄芪、红参、沙参、半夏、当归、生地、远志、白芍、瓜蒌、天麻、茵陈、薄公英、地丁、金银花、白芨等。
    草本植物  铁杆蒿、白茅、白羊草、黄菅草、野菊、茵陈等。
    菌类  木耳、银耳、蘑菇、香菇、平菇等。
    低中山针阔叶混交林带
    分布于海拔1200-1800米的广大地区,面积在境内所占比例最大,包括马角、东峪、韩峪川、铁炉子、牧护关、黑龙口、引龙寺、三岔河、东岳庙、林岔河、牛槽、砚池河、药王坪、黑山、闫村、上官坊、松树嘴、广东坪、韩子坪、大河面、龙王庙的全部及洪门河、火神庙、西荆、李庙、板桥、水道河、三十里铺、管坪、土门庵、麻池河、杨斜,西涧、两水寺、张涧、两岔口、会峪、碾子凹、北宽坪的大部分地区。
    此类地区植被良好,下部有栓皮栎林,山杨林等群系,还有油松林,白皮松林等。上部以油松林、华山松林、锐齿槲栎林、槲栎林、山杨林等群系为主,还白皮松林,青杠林、毛栗林等群系。
    油松林  分布广,数量多,是主要的森林资源。天然林多为松栎混交林,近年因人工干预有纯林化趋势。绝大部分为幼龄林,树高6-8米,平均胸径12-18厘米,干形通直,出材率高,使用范围广。
    华山松林  是高山地带的典型的森林群落,主要分在于牧护关、铁炉子、引龙寺、三岔河、牛槽东岳庙等地。目前尚为幼龄林,其组成为纯林或松栎混交,平均树高6-8米,胸径8-16米,林相较好。
    栓皮栎林  是阔叶林的建群树种,各地均有分布,常和松类针叶木混交形成森林植被类型。栓皮栎林,萌生力强,生长快,利用周期短(一般10年),经济效益大,是薪炭林的主要来源,也是木耳、天麻菌棒的来源。
    另外还有林下灌木和草本植物。
    中(高)山桦木林带
    分布于海拔1800米以上的地带,多在秦岭主脊部分,以秦王山地区最为典型。组成桦木林的优势树种是红桦,其次是牛皮桦、白华、光皮桦。郁闭度70-80%,树高8-11米,平均胸径20-26厘米。林中其他乔木有华山松、辽东栎、山杨、椴树、鹅耳枥、千金榆等。
    林下灌木有松花竹、六道木、照山白、忍冬、荚迷、杭子梢、绣线菊、花楸、榛子、杜鹃等。
    另外还有草本植物和一些经济价值很高的菌类,如天麻、猪苓、灵芝等适生在本区。